Joseph Larmarange

Décrire les épidémies, Comprendre les populations : une démographie du VIH en Afrique subsaharienne

Joseph LARMARANGE — 2022-10-14T06:38:12Z

Habilitation à Diriger des Recherches soutenue le 12 octobre 2012 par Joseph Larmarange à l'Université Paris Cité.
Décrire les épidémies, Comprendre les populations : une démographie du VIH en Afrique subsaharienne
Joseph Larmarange Démographie. Université Paris Cité, 2022 HDR tel-03814024

- Publications / Afrique subsaharienne, ATLAS, CAP-CoV-Soignants-BF, DOD-CI (ANRS 12287 / 12323), ELIHoS (ANRS 12139), PrEP CI (ANRS 12361), Prévalences du VIH (ANRS 12114), prevR, PRINCESSE, TasP (ANRS 12249), Afrique du Sud, Burkina Faso, Côte d'Ivoire, Mali, Sénégal, Accès aux soins, Analyse de séquences, Approches biographiques, Approches communautaires, Autotests VIH, Cartographie, Cascade des soins, Comparaison de cohortes, Comportements sexuels, Démographie, Dépistage, EDS (Enquêtes Démographiques et de Santé), Enquêtes par téléphone, Enseignement académique, Lien vers les soins, Épidémiologie, Essais cliniques, Estimateurs à noyau (kernel density estimation), Femmes enceintes, Financement des programmes, Hépatites virales, Homo / Bisexualités, Identités sexuelles, Incidence du VIH, Interpolation spatiale, IST (Infections Sexuellement Transmissibles), Itinéraires thérapeutiques, Masculinités, Ménages, Mesure d'impact, Mesure des indicateurs, Méthodologie, Migrations, Observatoire de population, Partenaires sexuel(le)s, PrEP, Prévalence du VIH, Prévention, Prise en charge, Recherche interventionnelle, Recherche participative/communautaire, Recrutement « boules de neige », Représentations / Perceptions, Représentativité et Biais, Santé publique, Santé sexuelle, Structure des populations, Structures de santé, Surveillance sentinelle, Téléphones mobiles, Temporalités, Traitement antirétroviral (ARV), Travail du sexe, Treatment as Prevention (TasP), Universal Test & Treat (UTT), Usageres de drogue, VIH / SIDA

RIPOST • Réseau des Instituts Nationaux de Santé Publique d'Afrique de l'Ouest

Joseph LARMARANGE — 2018-01-07T19:38:20Z

Partenariat

Financement

Agence Française de Développement (AFD)

Résumé

L'épidémie d'Ebola qui a sévi en Afrique de l'Ouest en 2014-2015 a révélé un certain nombre de faiblesses dans les dispositifs de veille, d'alerte, d'investigation, de réponse rapide et plus généralement des systèmes d'information en santé au niveau national et international.

Le projet déposé en consortium a pour chef de file l'AMP ; et ADERA-ISPED, Santé Publique France, IANPHI, IRD et Solthis pour membres. Ce projet cible 6 pays : Bénin, Burkina Faso, Côte d'Ivoire, Guinée, Niger et Togo pour l'axe consacré au renforcement des capacités en épidémiologie et la Côte d'Ivoire et la Guinée pour l'axe consacré à la mobilisation communautaire.

Axe renforcement des capacités :

Les responsables des institutions nationales de santé publique et de coordination nationale de la surveillance de la riposte
Les référents en matière de surveillance, investigation et systèmes d'information dans les régions et district sanitaires
Tout professionnel de santé publique (médecin, vétérinaire, pharmacien paramédical et ingénieur sanitaire), dont l'activité est axée sur la pratique de l'épidémiologie au niveau national et régional

Axe mobilisation communautaire :

Les experts et institutions nationales de santé publique pour la mise en œuvre, le suivi et l'analyse des enquêtes « Baromètre Santé »
Les référents en matière de surveillance, investigation et systèmes d'information dans les régions et districts sanitaires
Les informateurs communautaires clés pour l'accompagnement d'un dispositif de surveillance communautaire

Zone géographique

Bénin, Burkina Faso, Côté d'Ivoire, Guinée, Niger et Togo

Calendrier

2017-2021

Mesures et VIH en Afrique au travers de deux exemples : la prévalence du VIH et les prises de risques chez les homo-bisexuels sénégalais

Joseph LARMARANGE — 2009-02-18T16:09:40Z

Intervention de 3 heures dans le cadre du séminaire doctoral des étudiants inscrits en Master d'Anthropologie Spécialité Recherche « Anthropologie bioculturelle » (Centre de Recherche "Cultures, Santé, Sociétés", Université Paul Cézanne) et du Diplôme d'Université : Certificat international d'écologie humaine, Option "Ecologie Humaine et Santé".
Cette intervention a été découpée en deux parties. La première présentait une partie des résultats de la thèse. Pour plus de détails, voir (…)

- Enseignements / Prévalences du VIH (ANRS 12114), ELIHoS (ANRS 12139), VIH / SIDA, Homo / Bisexualités, Prévalence du VIH, Comportements sexuels, Prévention, Surveillance sentinelle, EDS (Enquêtes Démographiques et de Santé), Mesure des indicateurs, Sénégal, Afrique subsaharienne, Représentativité et Biais, Partenaires sexuel(le)s

Prévalences du VIH en Afrique sub-saharienne : Historique d'une estimation [HIV prevalence in sub-Saharan Africa: background of an estimation.]

Joseph LARMARANGE — 2009-01-22T13:59:31Z

Citation

Larmarange Joseph (2009). “Prévalences du VIH en Afrique sub-saharienne : Historique d'une estimation [HIV prevalence in sub-Saharan Africa : background of an estimation.]”, Médecine Sciences : M/S, 25, RIS, BibTeX.

Intro

Tous les deux ans, le programme commun des Nations-Unies sur le VIH/SIDA (ONUSIDA) publie des estimations détaillées du nombre de personnes infectées par le VIH (virus de l'immunodéficience humaine). Selon la dernière édition de son rapport, publiée en juin 2008, 33 millions de personnes (adultes et enfants) dans le monde dont 22 en Afrique subsaharienne seraient infectées en 2007. Cette estimation, largement reprise par les médias et les acteurs de la lutte contre le SIDA, a été révisée à maintes reprises ces dernières années. À titre d'exemple, le rapport 2002 estimait ce nombre à 28,5 millions en 2001 pour l'Afrique subsaharienne. Cette même estimation a été révisée à la baisse, dans la dernière édition du rapport, à 20,4 millions en 2001. Paradoxalement, le nombre de personnes infectées a augmenté entre 2001 et 2007. Les révisions successives effectuées par l'ONUSIDA ont semé le doute sur la qualité des estimations produites. Petit retour sur l'évolution des sources et des techniques.

Abstract

In 2008 UNAIDS global report on AIDS, the number of people living with HIV in sub-Saharan Africa was estimated at 22 millions in 2007 and 20.4 millions in 2001, while in the 2002 report, the same estimation for 2001 was 28.5 millions. Changes in UNAIDS reflects evolutions of data sources and methods used for the estimates. Sentinel surveillance of pregnant women attending antenatal clinics (ANC) was developed in 1980's with the WHO recommendation of unlinked anonymous testing approach. The objective was not to be representative but to monitor trends. In the 1990's, as ANC data were available, they were used by EpiModel, a model developed by WHO for HIV prevalence estimates from 1992 to 2000. In 2002, a new epidemiological model called EPP (Estimation and Projection Package) was developed by the UNAIDS Reference Group on Estimates, Modelling and Projections, which, in countries with a generalised epidemic, is still based on ANC data collected over time. Since 2001, many countries have conducted national population-based surveys (NPS). Their results have often diverged from estimates based on ANC data. This was explained by the under-representation of rural clinics in sentinel surveillance and relative small participation rate in NPS. Since, several studies have shown that the impact of several biases (participation rate, non-household members, serological window of tests...) in NPS remains relatively low. NPS constitute a good indicator of HIV prevalence level. If pregnant women can be locally representative of the general population, at the national scale, it depends of the localization of selected clinics. But ANC provides data over time, which is not the case for NPS. The current approach of UNAIDS consists in estimating HIV prevalence trends from ANC and the level of the epidemics from NPS. But the hypothesis that ANC data are representative of trends still needs to be verified when several NPS will be available for a same country.

Comparaisons locales de la surveillance sentinelle des femmes enceintes et des Enquêtes Démographiques et de Santé au Burkina Faso et au Cameroun

Joseph LARMARANGE — 2008-10-14T16:48:55Z

Poster présenté à la 15^e Conférence Internationale sur le Sida et les Infections sexuellement transmissibles en Afrique (CISMA - ICASA en anglais) du 3 au 7 décembre 2008 à Dakar.

Auteurs

J. Larmarange [1], R. Vallo [2], S. Yaro [3], P. Msellati [4], N. Méda [3], B. Ferry [1]

Abstract

Objectif

Les prévalences nationales du VIH ont été historiquement estimées à partir de la surveillance sentinelle en cliniques prénatales (CPN). Depuis 2001, les Enquêtes Démographiques et de Santé (EDS) en population générale constituent une nouvelle source d'informations. Pour plusieurs pays, les estimations entre ces deux sources divergent, principalement en raison de la localisation des sites sentinelles retenus. Certains travaux ont montré que les CPN pouvaient constituer un bon indicateur local. Nous cherchons ici à comparer localement EDS et CPN afin de préciser la représentativité de ces dernières.

Méthode

Nous avons eu recours à des techniques d'analyse en composantes d'échelle et d'interpolation spatiale afin de cartographier les variations infrarégionales de la prévalence du VIH à partir des EDS. La méthode employée a été testée à partir d'une modélisation avant d'être appliquée aux EDS 2003 du Burkina Faso et 2004 du Cameroun. Un programme informatique a été spécialement conçu à cette fin (http://www.ceped.org/prevR). Nous obtenons les tendances régionales de la prévalence du VIH dans un rayon de 30 à 90 kilomètres, que nous comparons avec les données CPN.

Résultats

La prévalence du VIH mesurée en CPN est fortement dépendante de la zone de recrutement (ZR) de cette dernière. Pour les petites agglomérations isolées, le nombre limité de cliniques induit que leur ZR correspond approximativement à l'agglomération et son voisinage plus ou moins proche. Dans les grandes villes ou les régions fortement urbanisées, la diversité des CPN disponibles rendent les ZR plus complexes. Elles peuvent s'interpénétrer et/ou se superposer. Les CPN ne seront pas forcément représentatives de l'agglomération étudiée. Les CPN situées en milieu rurale traduisent pour leur part une prévalence très localisée qui peut diverger de la tendance régionale.

Conclusion

La surveillance sentinelle en CPN peut s'avérer un mauvais indicateur des niveaux régionaux de l'épidémie, en fonction de leurs zones de recrutement et des variations spatiales de la prévalence. Une comparaison avec d'autres sources est donc nécessaire avant de pouvoir généraliser une observation réalisée en CPN. Cependant, elle reste adaptée pour une surveillance locale des tendances temporelles de l'épidémie.

[1] IRD – CEPED UMR 196 Paris Descartes INED IRD, Paris, France

[2] Université de Montpellier I – EA 4205, Montpellier, France

[3] Centre Muraz, Bobo-Dioulasso, Burkina Faso

[4] IRD – UMR 145, Marseille, France

L'Évaluation de la prévalence du VIH en Afrique

Joseph LARMARANGE — 2008-05-26T13:00:00Z

Journée Scientifique de la Faculté de Sciences Humaines et Sociales de l'Université Paris Descartes sur le thème de « L'Évaluation ».

Résumé

Régulièrement, ONUSIDA publie des estimations de la prévalence du VIH. Ces dernières ont subi plusieurs révisions importantes ces dernières années du fait de la publication de nouvelles données. Dans les années 1990, la prévalence du VIH a été essentiellement estimée à partir de la surveillance sentinelle des femmes enceintes. Depuis 2001, se sont multipliées des enquêtes nationales en population générale avec dépistage du VIH, qui fournissent une estimation plus précise des niveaux des épidémies et mettent en lumière les limites de la surveillance sentinelle. Cependant, moins chère et plus facile à mettre en œuvre, cette dernière fournit des données annuelles tandis que les enquêtes en population générale n'ont lieu que tous les 5 à 10 ans. La démarche actuelle d'ONUSIDA consiste donc à estimer les niveaux à partir d'enquêtes en population générale et les tendances à partir de la surveillance sentinelle.

Projet de Recherche

Mesures et Ajustement des prévalences du VIH

Prévalences du VIH en Afrique : validité d'une mesure

Joseph LARMARANGE — 2007-10-01T13:37:36Z

Larmarange Joseph (2007). Prévalences du VIH en Afrique : validité d'une mesure, thèse pour l'obtention du grade de docteur en démographie, Université Paris Descartes (http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00320283/fr/), RIS, BibTeX.

Jury

– Benoît FERRY (IRD) - Directeur
– Yves CHARBIT (Université Paris Descartes) - Président
– Éva LELIÈVRE (INED) - Rapporteur
– Philippe MSELLATI (IRD) - Rapporteur
– Arnaud FONTANET (Institut Pasteur)
– Nicolas MÉDA (Centre Muraz - Burkina Faso)

Projet de recherche associé :

– Mesures et Ajustement des prévalences du VIH

Prévalences du VIH en Afrique : validité d'une mesure

Les prévalences nationales du VIH sont estimées, en Afrique subsaharienne, à partir de deux sources : la surveillance sentinelle des femmes enceintes et les enquêtes nationales en population générale (EDS). En plusieurs endroits, les résultats divergent, questionnant la validité de chaque approche. Quelles portée, limites et signification objective peuvent être accordées aux diverses observations, chacune appréhendant le réel sous un angle différent ?

Les EDS constituent un bon indicateur du niveau des épidémies à l'échelle national et régional, voir infrarégional grâce au recours à des techniques d'analyse spatiale en composantes d'échelles. Mais leur fréquence est inadaptée pour mesurer les évolutions à court terme. La surveillance sentinelle, estimateur local des ordres de grandeur, peut être un indicateur de tendances sous certaines conditions. Cependant, si la situation actuelle commence à être mieux connue, une mesure réelle des dynamiques est encore hors de notre portée.

Mots-Clés

VIH/SIDA, Afrique subsaharienne, prévalence, validité épistémologique, EDS (Enquêtes Démographiques et de Santé), surveillance sentinelle, interpolation spatiale, épidémiologie.

HIV prevalence in Africa : validity of a measurement

HIV national prevalence is estimated, in sub-Saharan Africa, from two main data sources : sentinel surveillance of pregnant women and national population-based surveys (DHS). In several countries, results differ, questioning each of those approaches' efficiency. What range, limitations and objective significance can be granted to the diverse observations, each apprehending the real from a different point of view ?

DHS constitute a good indicator of prevalence levels at a national or a regional scale. Intraregional variations can be reproduced by using spatial analysis techniques. But DHS frequencies are inaccurate to measure short-term evolution. Sentinel surveillance, local estimator of magnitude of epidemics, can be a tendency indicator under certain conditions. However, if the present situation is only just starting to be better-known, a real measurement of HIV dynamics is still out of our reach.

Key Words

HIV/AIDS, sub-Saharan Africa, prevalence, epistemological validity, DHS (Demographic and Health Surveys, sentinel surveillance, spatial interpolation, epidemiology.

Estimations des prévalences du VIH en Afrique subsaharienne : principaux résultats du projet ANRS 12114

Joseph LARMARANGE — 2007-09-15T13:39:00Z

- Communications / Prévalences du VIH (ANRS 12114), VIH / SIDA, Surveillance sentinelle, EDS (Enquêtes Démographiques et de Santé), Mesure des indicateurs, Afrique subsaharienne

Variations spatiales infranationales de la prévalence du VIH en Afrique (projet ANRS 12114)

Joseph LARMARANGE — 2007-02-26T14:11:15Z

4^e Conférence Francophone sur le VIH/Sida, organisée sous l'égide de l'ANRS, 29-31 mars 2007 à la Cité des Sciences et de l'Industrie de Paris.

3Thème :3
Épidémiologie

3Auteurs :3

LARMARANGE Joseph, VALLO Roselyne, YARO Seydou, MSELLATI Philippe, MEDA Nicolas, FERRY Benoît.

3Objectif3

Plusieurs pays africains disposent dorénavant d'une Enquête Démographique et de Santé (EDS) en population générale, avec dépistage du VIH et coordonnées géographiques des zones d'enquête. L'utilisation de ces données permet de reconstruire en partie les variations spatiales de la prévalence du VIH à des niveaux infrarégionaux. La connaissance de ces variations constitue un outil pour l'évaluation, la planification et le plaidoyer et permet de mieux comprendre les écarts observés entre les EDS et la surveillance sentinelle des femmes enceintes.

3Méthodes3

La prévalence du VIH de chaque zone d'enquête d'une EDS a été estimée à partir des zones voisines en tenant compte des principales agglomérations urbaines ; puis une interpolation par krigeage a été effectuée. Des indicateurs de qualité des estimations produites ont également été générés. La validité de cette méthodologie a été vérifiée par simulation d'enquêtes sur un pays modèle. Cette approche a été appliquée aux données des EDS du Burkina Faso et du Cameroun et les cartes produites discutées avec les experts nationaux de ces deux pays. Un outil informatique gratuit a par ailleurs été réalisé.

3Résultats3

Nos résultats soulignent l'hétérogénéité spatiale des épidémies au niveau régional et infrarégional. Les zones les plus touchées correspondent, pour une majorité, aux villes situées sur les principaux axes routiers et aux zones historiques de migrations. La comparaison au niveau local entre EDS et surveillance sentinelle montre que ces deux mesures correspondent à deux échelles géographiques différentes ; elle fournit des pistes de réflexions sur la manière complémentaire d'utiliser ces deux sources d'informations. La surveillance sentinelle est plus adaptée au suivi des tendances d'une épidémie locale, tandis que les EDS sont plus pertinentes pour mesurer le niveau global de la prévalence du VIH à l'échelle nationale ou régionale.

3Conclusions3

Malgré plusieurs limites, cette méthode affine la connaissance des épidémies nationales et constitue un outil d'aide à la prise de décision. La variation spatiale de la prévalence est la résultante de dynamiques épidémiques et migratoires complexes. L'analyse des différences d'échelles et de représentativité des diverses sources est primordiale.

Mesures et Ajustement des prévalences du VIH

Joseph LARMARANGE — 2007-02-23T14:52:15Z

Ce projet IRD - Centre Muraz s'intitule Mesure et Ajustement des prévalences nationales du VIH en Afrique Subsuharienne - Application à trois sites ANRS : Burkina Faso, Cameroun et Sénégal.

Responsables :

Benoît FERRY (IRD) et Nicolas Méda (Centre Muraz, Burkina Faso)

Financement :

ANRS (Agence Nationale de Recherche sur le Sida et les hépatites virales). Projet 12114.

Thèse réalisée dans le cadre de ce projet :

– Prévalences du VIH en Afrique : validité d'une mesure

Calendrier

2005-2007

Résumé

À la demande de l'ANRS, il a été convenu de centrer ce travail sur les sites ANRS : Burkina Faso, Cameroun et Sénégal. Ce projet s'inscrit dans un partenariat entre l'IRD et le Centre Muraz d'une part, mais aussi, plus largement, avec les chercheurs et experts nationaux engagés dans la surveillance épidémique de chaque pays.

Aujourd'hui, il est encore difficile d'avoir une image précise des niveaux et tendances actuels des prévalences des épidémies de VIH, comme en témoignent les récentes révisions qu'ONUSIDA a faites de ses estimations. Si dans les pays en développement la majorité des données concernent les femmes en suivi prénatal ou des groupes à risques, les enquêtes nationales en population générale sont de plus en plus nombreuses, en particulier les Enquêtes Démographiques et de Santé (EDS) qui intègrent dorénavant un module de test de dépistage du VIH. Il importe de recouper ces deux sources d'informations et d'affiner les données en tenant compte des biais propres à chacune et du contexte spécifique à chaque pays.

Le présent projet vise à améliorer les méthodes d'évaluation et de validation des estimations nationales du VIH dans les pays ; à généraliser des méthodes d'ajustement simple des données applicables à moindre coût dans un programme de suivi de l'épidémie ; à mettre au point un protocole d'ajustement des données afin d'êtres exploitables par des modèles épidémiologiques ; et à vérifier la validité de deux modèles épidémiques aux trois pays étudiés.

La méthodologie retenue s'appuie essentiellement sur une analyse comparative et contextuelle des différentes sources (femmes enceintes, EDS, recensement de populations, enquêtes par cohortes comme le projet VIRUS au Burkina Faso...). Une première série de missions permettra de rencontrer les autorités nationales, de collecter les données et d'établir les contextes de chaque pays. Ces différentes sources seront systématiquement comparées à population et géographie égale. Pour chaque pays, une méthode globale d'ajustement sera proposée en fonction de chaque contexte et les tendances seront ré-évaluées.

L'analyse sera complétée par l'application des données à deux modèles épidémiques et les résultats comparés avec l'Afrique du Sud (pays de référence en matière de modélisation). Une seconde série de missions permettra de vérifier la cohérence des analyses et le bien-fondé des approches à l'occasion d'un atelier de restitution avec les autorités nationales et les chercheurs locaux. La collecte d'informations se fera dans les pays, avec les chercheurs nationaux et les coordinateurs Sud de l'ANRS. Les analyses statistiques seront essentiellement réalisées par Joseph LARMARANGE, sous la direction de Benoît FERRY. Le Centre Muraz apportera son appui technique et méthodologique aux différentes étapes de ce travail.

Mots-clés

Pays en Développement, Prévalence, Mesure, Ajustements, Méthodologie.

Abstract

This project is funded by the ANRS (second call for tenders 2005). At the ANRS's request, it was agreed to focus this work on ANRS sites : Burkina Faso, Cameroon and Senegal. This project is based on a partnership between the IRD and the Muraz Center on one hand, but also, more largely, with the national researchers and experts involved in the epidemic monitoring of each country.

Today, it is still difficult to have a precise knowledge of the current levels and tendencies of HIV prevalence epidemics, as shown by the recent revisions of UNAIDS estimates. In developing countries, most data come from antenatal clinical attendees and groups at risk. But national surveys in general population are increasingly frequent, in particular Demographic and Health Surveys (DHS) which integrate now a HIV test module. It is important to compare these two sources of information and to refine the data by taking account of skews and specific context of each country.

This project aims at improving validation and adjustment methods of national HIV estimates ; at generalizing simple adjustments methods for a law cost ; at developing an adjustment protocol exploitable by epidemiologic models ; and at checking validity of two epidemic models applied to the three studied countries.

Methodology selected is based primarily on a comparative and contextual analysis of various sources (antenatal clinical attendees, DHS, population census, cohort studies like the VIRUS project in Burkina Faso...). A first series of travels is provided in order to meet the national authorities, to collect the data and to establish the context of each country. The various sources will be systematically compared at equal population and geography. For each country, a global adjustment method will be proposed according to each context, and epidemic tendencies will be re estimated.

The analysis will be complemented by the application of two epidemic models and the results compared with South Africa (reference country for modelling). Coherence of the analyses and validity of the approaches will be checked. At the same time a restitution workshop will be organized with the national authorities and the local researchers of each country.

Data gathering will be done in the countries with the national researchers and the Southern ANRS coordinators. Statistical analyses will be primarily carried out by Joseph LARMARANGE, under the direction of Benoît FERRY. The Muraz Centre will bring its technical and methodological support at the various stages of this work.

Key-Words

Developing Countries, Prevalence, Measure, Adjustments, Methodology.

À consulter

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